254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0043 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0041  tRNA-Pro  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000127927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  94.67 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  94.67 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0044  tRNA-Pro  92 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000299303  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0092  tRNA-Pro  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0046  tRNA-Pro  91.94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.372739  normal  0.328278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0035  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000101815  hitchhiker  0.00514496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0002  tRNA-Pro  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0022  tRNA-Pro  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283237  normal  0.256821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0050  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0011  tRNA-Pro  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0076  tRNA-Pro  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000227874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0040  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000750731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0036  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000605853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0051  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>