More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0024 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0054  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27400  tRNA-Met  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0222843  normal  0.668834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0055  tRNA-Met  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0040  tRNA-Met  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0071  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0072  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27450  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0048  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0018  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0009  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0013  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0010  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0009  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0013  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  94.81 
 
 		 80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  94.81 
 
 		 79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0049  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 		 80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  93.51 
 
 		 79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000159293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000423304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>