298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_R0027 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.841138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27400  tRNA-Met  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0222843  normal  0.668834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0018  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0013  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0055  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0046  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0040  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0054  tRNA-Met  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0072  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0071  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0048  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27450  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  97.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0010  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0009  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0013  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0009  tRNA-Met  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000423304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000159293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0049  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>