162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0004 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.298901  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0039  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  92.65 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  89.09 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  89.09 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.15 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.453566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_757  tRNA-Gly  86.15 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0984996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  87.72 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  96.77 
 
 
75 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  86.44 
 
 
76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0064  tRNA-Gly  83.78 
 
 
75 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.729531  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0024  tRNA-Gly  84.62 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103338  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.110227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000147856  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103992  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000227912  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000021714  normal  0.246057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0038  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000220683  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  83.58 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0062  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175369  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0063  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227947  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0819  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309267  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  85.45 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255817  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 
67 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>