29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_R0019 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.537807  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0026  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  133  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2898  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.685714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  85.07 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527994  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0006  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>