183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_757 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.453566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_757  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0984996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0024  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0040  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0018  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0035  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0034  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0043  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.530353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0028  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0045  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14070  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0004  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.298901  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0039  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_639  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0061  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28400  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0941347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  87.5 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0001  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0002  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>