60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0024 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0022  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.997438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0037  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11980  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000114191  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11950  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000172827  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0019  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.739612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0010  tRNA-Trp  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948194  hitchhiker  0.0000000000358204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0043  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.530353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0034  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0010  tRNA-Trp  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000288959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  83.82 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0035  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0018  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 67 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0036  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000263314  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0051  tRNA-Gly  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0001  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0023  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506131  normal  0.313927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0001  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0002  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  88 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0001  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0002  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0024  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0002  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0001  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>