29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0022 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0020  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0669163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0024  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0007  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0002  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0002  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0001  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.285544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0024  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0002  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0036  tRNA-Gly  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000263314  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0001  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00219476  hitchhiker  0.0000103826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0019  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>