201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_R0046 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  97.4 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  97.4 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0020  tRNA-Gly  94.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0669163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt11  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0046  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0010  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t39  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0034  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000649431  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0020  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000806008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0045  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000300165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 67 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0002  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  92.86 
 
 		 108 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  92.86 
 
 		 71 bp  60  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0018  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0053  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000638306  hitchhiker  0.00279768 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0033  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.974847  normal  0.895856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0025  tRNA-Gly  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.157688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0022  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.997438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0007  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>