34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0011 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0042  tRNA-Val  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0009  tRNA-Val  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.31533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0014  tRNA-Val  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0012  tRNA-Val  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.423329  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0005  tRNA-Val  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0804752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0030  tRNA-Val  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.767632  normal  0.452348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0044  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0032  tRNA-Val  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0031  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.213093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0036  tRNA-Val  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0023  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0023  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04020  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.730789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03660  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.018948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>