34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0042 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  133  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  95.31 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0020  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0018  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0047  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0043  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.455129  normal  0.0350776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0006  tRNA-Val  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.330961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0037  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0720362 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0302721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>