21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0047 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0034  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>