20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0043 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  93.33 
 
 		 78 bp  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  94 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  90.48 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  93.62 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  93.62 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  91.53 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  93.18 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  90.7 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  90.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>