18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0063 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  93.62 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  95 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  93.18 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  86.15 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  91.67 
 
 
95 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  100 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0043  tRNA-Met  91.18 
 
 
106 bp  44.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>