72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_R0008 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  93.42 
 
 
75 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0033  tRNA-Met  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  91.84 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  90.57 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0026  tRNA-Met  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.963171  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R17  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  94.59 
 
 
78 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  89.8 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  89.8 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  85.53 
 
 
77 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0020  tRNA-Met  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  85.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  91.89 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  82.89 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Met-3  tRNA-Met  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  93.75 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  87.23 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0015  tRNA-Met  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.012371 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  86.21 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  86.21 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  91.18 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  86.96 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0062  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0374221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0001  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220439  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  83.87 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  83.87 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>