116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_R0083 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0034  tRNA-Met  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.029342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0074  tRNA-Met  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_641  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000945354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0015  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000125426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 155 bp  61.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0006  tRNA-Met  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0204099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0046  tRNA-Lys  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.856653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0026  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.963171  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  87.76 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0032  tRNA-Met  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0074  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0033  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0034  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0077  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.435861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0076  tRNA-Met  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0079  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt41  tRNA-Val  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>