22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0046 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  91.53 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0083  tRNA-Met  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000161068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0041  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000311146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0078  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0983896 
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0007  tRNA-Met  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>