194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0017 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  93.48 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  91.3 
 
 		 95 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  93.18 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0031  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.61738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0746  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  89.13 
 
 		 122 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0018  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t64  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t65  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247556  normal  0.186781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t66  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.190236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t67  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.19275 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0080  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0079  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0081  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0026  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.826255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0078  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0042  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0180356  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0043  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0100237  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0044  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00997597  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0045  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0174897  normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  87.5 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26840  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00889349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>