More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0746 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0746  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.92 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  90.91 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0057  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  92.19 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  91.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0633  tRNA-Met  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000739177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  89.61 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>