36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0065 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  96.83 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  93.33 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  95.74 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  93.48 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  90 
 
 		 95 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  88.24 
 
 		 122 bp  54  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0046  tRNA-Met  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.413115  normal  0.314487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>