29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_1 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  97.73 
 
 		 122 bp  79.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_2  tRNA-OTHER  92.06 
 
 		 113 bp  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  90 
 
 		 78 bp  60  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0013  tRNA-OTHER  100 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.689744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0010  tRNA-OTHER  91.3 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  90 
 
 		 75 bp  60  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0009  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 119 bp  52  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0001  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.955774  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0018  tRNA-OTHER  89.13 
 
 		 107 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0037  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0026  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.920419  normal  0.82978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>