15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0070 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  100 
 
 		 95 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0037  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0720362 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>