22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0029 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  88.46 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4575  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0034  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>