22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0037 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0037  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0720362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0002  tRNA-Ile  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.683512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0050  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34030  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76483  normal  0.54682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0075  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.532419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25110  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0007  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0008  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06160  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.599114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>