144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0048 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  88.89 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  89.39 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  89.39 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  94 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  89.06 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  89.06 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  88.71 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.77 
 
 
80 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  96.77 
 
 
80 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0013  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199556  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0002  tRNA-Ile  90.7 
 
 
74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.683512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0385  tRNA-Ile  90.7 
 
 
79 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.900506  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0073  tRNA-Met  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4994  tRNA-Met  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3083  tRNA-Ile  90.7 
 
 
79 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0051  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094292  normal  0.53316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0010  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.448229  hitchhiker  0.009241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0104  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0114  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00121971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0019  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.682883  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0028  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0037  tRNA-Ile  88.89 
 
 
75 bp  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0720362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0018  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0278993  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.55 
 
 
80 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000422709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-8  tRNA-Met  96.55 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000362106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0006  tRNA-Met  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0011  tRNA-Met  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000297005  normal  0.027771 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01870  tRNA-Phe  90.91 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0564  tRNA-Met  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1574  tRNA-Met  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1609  tRNA-Met  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.824013 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0032  tRNA-Met  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097362  normal  0.0784713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0007  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0005  tRNA-Ile  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00223739  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0023  tRNA-Ile  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000132688  unclonable  0.00000666123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0051  tRNA-Ile  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  normal  0.790944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>