299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0055 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  93.55 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  95.92 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  97.73 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  97.73 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  94 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  94 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  94 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0018  tRNA-Met  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144719  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21420  tRNA-Met  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000610932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0043  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  97.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0012  tRNA-Met  93.62 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097362  normal  0.0784713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0007  tRNA-Met  93.62 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08640  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000480255  hitchhiker  0.000000163212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  94.87 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  88.89 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0028  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0018  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0278993  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0104  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013625  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  88.89 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>