More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0012 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0043  tRNA-Ile  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0051  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094292  normal  0.53316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0385  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.900506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0010  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.448229  hitchhiker  0.009241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3083  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0038  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0013  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0038  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0012  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0037  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0013  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0033  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>