299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0015 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  95.31 
 
 
74 bp  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  97.96 
 
 
77 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  95.92 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  95.92 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  95.56 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  95.45 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  95.45 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  95.45 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  97.44 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  97.44 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4994  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  86.49 
 
 
80 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  86.49 
 
 
80 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  86.49 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21420  tRNA-Met  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000610932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  90.57 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  90.57 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  90.57 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>