299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0053 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  95.16 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0018  tRNA-Met  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144719  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0050  tRNA-Met  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21420  tRNA-Met  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000610932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0007  tRNA-Met  93.62 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>