299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_R0012 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  96.61 
 
 
77 bp  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  95.92 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  95.92 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  97.73 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  97.67 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  89.39 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  93.88 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt47  tRNA-Met  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0050  tRNA-Met  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180994 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  95 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  95 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0018  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000031299  normal  0.0565346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0023  tRNA-Met  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0015  tRNA-Met  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0036  tRNA-Met  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756842  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0018  tRNA-Met  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144719  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309376  tRNA-Met  86.67 
 
 
74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515104  hitchhiker  0.0000016198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3083  tRNA-Ile  90.7 
 
 
79 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0385  tRNA-Ile  90.7 
 
 
79 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.900506  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21420  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000610932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0045  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0010  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.448229  hitchhiker  0.009241 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0051  tRNA-Ile  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094292  normal  0.53316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0010  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2248  tRNA-Met  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  94.12 
 
 
74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1560  tRNA-Met  86.21 
 
 
79 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.443408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.48 
 
 
80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.48 
 
 
80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  90.48 
 
 
80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  90.48 
 
 
80 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  94.12 
 
 
74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  94.12 
 
 
74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>