108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-7 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-7  tRNA-Met  100 
 
 
80 bp  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000430369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5025  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5810  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0221  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000903582  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4994  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5723  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00377961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0130  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0134  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00862891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-5  tRNA-Met  98.75 
 
 
80 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000422709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5645  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000266737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-6  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00371992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-6  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000564951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-8  tRNA-Met  98.72 
 
 
78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000362106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000893597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0203721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0071  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5628  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00010832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5249  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000109559  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0068  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0013  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0012  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0083  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-4  tRNA-Met  98.61 
 
 
77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0053  tRNA-Met  98.61 
 
 
77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0053  tRNA-Met  98.61 
 
 
77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.744028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0073  tRNA-Met  98.61 
 
 
74 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0138692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0564  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0032  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1574  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1609  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.824013 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0034  tRNA-Met  94.37 
 
 
74 bp  109  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1221  tRNA-Met  92.96 
 
 
74 bp  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.379489  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0030  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0174  tRNA-Met  95.24 
 
 
74 bp  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0016  tRNA-Met  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000151702  hitchhiker  0.0080631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0012  tRNA-Met  90.38 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0979779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08640  tRNA-Met  93.18 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000480255  hitchhiker  0.000000163212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0020  tRNA-Met  90.2 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.070977  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0031  tRNA-Met  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0050  tRNA-Met  90 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000010044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0025  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0030  tRNA-Met  88.46 
 
 
77 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00179539  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  84.21 
 
 
77 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0054  tRNA-Met  94.44 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0953883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0036  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000218585  hitchhiker  0.0000000000151476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2791  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000913036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2794  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000175616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2477  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00937631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2480  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0019483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0049  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.219077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0054  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980959  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0053  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0058  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0038  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000704091 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0009  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000171351  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0024  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0073  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0026  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0047  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  84.38 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000649431  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0024  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0037  tRNA-Met  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000950191  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0046  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.367362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0036  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429203  normal  0.313017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  85.19 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  85.19 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0421283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>