279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0016 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0016  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.657071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0044  tRNA-Met  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21420  tRNA-Met  92.19 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000610932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0019  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0039  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0009  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.374214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0033  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>