More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0033 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0033  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna50  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000949027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0009  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102248  normal  0.0119324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0088  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156507  normal  0.184684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0004  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000767494  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna57  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000350129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0083  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000277539  normal  0.33634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0005  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00223739  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0023  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000132688  unclonable  0.00000666123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0051  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0043  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0053  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>