More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ile-3 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00001  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00294227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00071  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0102  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00845186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0020  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00394718  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4348  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.265257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4353  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5004  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000283414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0064  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0058  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4714  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504108  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5077  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000584569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5092  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866499  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0072  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0003  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00132267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0051  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0092  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00539323  decreased coverage  0.00141538 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0064  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0085  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0425046  normal  0.137972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0003  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0042  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0016  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00171399  hitchhiker  0.0041284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4641  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000032657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4704  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142472  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>