More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_R0022 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0043  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0053  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 80 bp  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0083  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000277539  normal  0.33634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0004  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000767494  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0009  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.102248  normal  0.0119324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna50  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000949027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0088  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156507  normal  0.184684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna57  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000350129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  98.18 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  98.18 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  98.18 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  98.18 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0012  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0033  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  95.16 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0046  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0005  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00223739  hitchhiker  0.00317207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0023  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000132688  unclonable  0.00000666123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0051  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0030  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0041  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.339834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>