More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2506 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  98.63 
 
 		 80 bp  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  98.63 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  97.26 
 
 		 79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  98.41 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  98.41 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0080  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0047  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0053557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  98.18 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0041  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0023  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00128376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>