More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0009 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0009  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.374214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0017  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000664856  normal  0.0132434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  90 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  90 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  90 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.86 
 
 
80 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  89.71 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  92.86 
 
 
79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4324  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101134  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0064  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375989  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0052  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0058  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0064  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>