More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  93.59 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000532501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 80 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0058  tRNA-Ile  96.08 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>