18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0051 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.385957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0045  tRNA-Ile  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0016  tRNA-Ile  87.84 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0286142  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  94.74 
 
 
86 bp  60  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0037  tRNA-Ile  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0720362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  90.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.43 
 
 
101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  83.33 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  83.33 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  86.54 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>