16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_2 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  224  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  92.06 
 
 		 95 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  92.45 
 
 		 95 bp  73.8  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  85 
 
 		 101 bp  67.9  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0019  tRNA-OTHER  90.57 
 
 		 95 bp  65.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.661812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0010  tRNA-OTHER  93.62 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0013  tRNA-OTHER  100 
 
 		 116 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.689744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  58  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  58  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  86.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0009  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 119 bp  54  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 122 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t45  tRNA-Thr  100 
 
 		 130 bp  46.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00118022  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0018  tRNA-OTHER  86.96 
 
 		 107 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>