21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ABOO_t45 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  ABOO_t45  tRNA-Thr  100 
 
 		 130 bp  258  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00118022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 113 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.243452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13160  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.10655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>