115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0008 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t45  tRNA-Thr  100 
 
 		 130 bp  71.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00118022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0008  tRNA-Thr  93.18 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0978186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0024  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35760  tRNA-Thr  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575984  normal  0.377782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0021  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178891  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0032  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0009  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0014  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0015  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101097  hitchhiker  0.004712 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0047  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2437  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2439  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2442  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2941  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.161896  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2147  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2149  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2152  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2624  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0032  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0041  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0030  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0069  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000181822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0007  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19940  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.53121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>