100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0045 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0039  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0026  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0144424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0014  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0011  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.312587  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0031  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0034  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0042  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0035  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0038  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.944323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0023  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0236487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0008  tRNA-Thr  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0245883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0038  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.40901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0007  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0017  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0037  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0038  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.266869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0026  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0051  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t14  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0029  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.951156 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0042  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0931  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0760  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.537807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0055  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0017  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395224  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0005  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0057  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0053  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.702685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0047  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0055  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00352038  hitchhiker  0.00739911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2898  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.685714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0021  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0582206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0046  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0016  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000757074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t45  tRNA-Thr  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00118022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52560  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0053  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0029  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527994  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>