14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0026 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0037  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0026  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.920419  normal  0.82978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  89.66 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0045  tRNA-Ile  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.908431  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  86.15 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 95 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0011  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.903466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  86.44 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0011  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0014  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>