9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0037 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0037  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0026  tRNA-Ile  98.51 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.920419  normal  0.82978 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0045  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.908431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0014  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0011  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  86.21 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>