80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0016 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0063  tRNA-Met  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  95.35 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  95.35 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  89.06 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  93.02 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  87.93 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0012  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  85.94 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0043  tRNA-Met  94.12 
 
 		 106 bp  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0012  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0011  tRNA-Met  88.31 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.019669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  84.38 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  84.38 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0043  tRNA-Met  90.7 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_1  tRNA-Ile  88.37 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0027  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0007  tRNA-Met  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0007  tRNA-Met  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.860787  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0007  tRNA-Met  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000197967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0054  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0062  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0055  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0046  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0668853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0047  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.0659545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0004  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0063  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0050  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0424906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27400  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0222843  normal  0.668834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27450  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0049  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0018  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0040  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0071  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0072  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0012  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.212092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0013  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156477  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0048  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0049  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0026  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0050  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0359841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0051  tRNA-Met  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0026  tRNA-Ile  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0025  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>