121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0041 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  95.35 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0037  tRNA-Met  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000950191  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  93.62 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  93.48 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0014  tRNA-Met  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0467162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0044  tRNA-Met  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0034  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  88 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  88 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0041  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  86.54 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0202  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0004  tRNA-Met  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00235  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00686486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05381  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0141064  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0079  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897328  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0053  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0071  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  86 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0021  tRNA-Met  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00425805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0012  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097362  normal  0.0784713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000352314  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0047  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>