14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_R0011 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  92 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>