21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0012 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0002  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.837764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>