25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0002 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0002  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.837764  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0021  tRNA-Gln  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t70  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 121 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000107168  unclonable  0.00000000962394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3941  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307752  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3134  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000254951  hitchhiker  0.00502595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2944  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2976  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000227205  decreased coverage  0.0000509713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3011  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  hitchhiker  0.0000219403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3027  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000838388  decreased coverage  0.00000641147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3291  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.24422e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2817  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020425  hitchhiker  0.000210656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000116075  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00050  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5063  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000188963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4692  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.17965e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0074  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000641426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0021  tRNA-Gln  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0047  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 112 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0009  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 112 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.149139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0037  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.35698e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>